شناسایی یک صفحه نمایش حذفی CRISPR-Cas9 ژنوم ضروری و محدودکننده رشد در سلول‌های بنیادی تروفوبلاست انسانی
مشتق اخیر سلول‌های بنیادی تروفوبلاست انسانی (hTSCs) یک سیستم مدل آزمایشگاهی مقیاس‌پذیر از رشد جفت انسان را فراهم می‌کند، اما تنظیم‌کننده‌های مولکولی هویت hTSC تاکنون به طور سیستماتیک مورد بررسی قرار نگرفته‌اند.
مشتق اخیر سلول‌های بنیادی تروفوبلاست انسانی (hTSCs) یک سیستم مدل آزمایشگاهی مقیاس‌پذیر از رشد جفت انسان را فراهم می‌کند، اما تنظیم‌کننده‌های مولکولی هویت hTSC تاکنون به طور سیستماتیک مورد بررسی قرار نگرفته‌اند. در این مقاله، محققان از یک صفحه نمایش حذفی CRISPR-Cas9 در سراسر ژنوم برای شناسایی جامع ژن‌های ضروری و محدودکننده رشد در hTSCها استفاده می‌کنند. با ارجاع متقابل داده‌ها به داده‌های صفحه‌نمایش ژنتیکی مشابه انجام‌شده در سایر انواع سلول و همچنین داده‌های بیان ژن از جنین‌های اولیه انسان، تنظیم‌کننده‌های اختصاصی و غنی‌شده hTSC تعریف شده‌اند.
این‌ها شامل تنظیم‌کننده‌های تروفوبلاستی هستند که به خوبی تثبیت‌شده و قبلاً مشخص نشده‌اند، مانند ARID3A، GATA2، TEAD1 (ضروری)، GCM1، PTPN14، و TET2 (محدود کننده رشد). تجزیه و تحلیل یکپارچه دسترسی کروماتین، بیان ژن، و داده‌های موقعیت ژنومی در سراسر ژنوم نشان می‌دهد که فاکتور رونویسی TEAD1 بیان بسیاری از تنظیم‌کننده‌های تروفوبلاست را در hTSCs تنظیم می‌کند. در غیاب TEAD1، hTSCها در تمایز به سلول‌های تروفوبلاست خارج پرز (EVT) شکست می‌خورند و در عوض نسبت به تمایز سینسیتیوتروفوبلاست (STB) تمایل نشان می‌دهند؛ بنابراین نشان می‌دهد که این فاکتور رونویسی از پتانسیل دودمانی hTSCها محافظت می‌کند. به طور کلی، این مطالعه منبع ارزشمندی برای تشریح تنظیم مولکولی رشد جفت و بیماری‌های جفت انسان فراهم می‌کند.
ارسال به دوستان